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Instalação do Linux
Recomendamos fortemente que as práticas sejam realizadas utilizando a versão mais recente do Ubuntu (www.ubuntu.com) de forma a garantir a atualização das bibliotecas necessárias para os programas relacionados nesta apostila.
O Ubuntu pode ser instalado de três maneiras principais
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Em um sistema solo boot - O Ubuntu será o único sistema operacional do computador.
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Em um sistema dual boot – O Ubuntu é instalado lado-a-lado com o Windows e os dois sistemas operacionais coexistem em um mesmo computador. O usuário escolhe em uma tela de início em qual sistema ele deseja trabalhar.
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Em uma máquina virtual – O Ubuntu roda dentro do Windows, como um aplicativo qualquer. Como serão dois sistemas operacionais rodando ao mesmo tempo, recomendamos esse tipo de instalação apenas para computadores de última geração.
PS:
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Durante a instalação, você terá que optar por um nome para o computador em questão. Neste tutorial nós adotaremos o nome curie (em homenagem à Srta. Curie, J). Escolha livremente o um nome diferente e substitua no passo-a-passo do tutorial.
2Para computadores obsoletos, recomendamos a instalação do Lubuntu – Uma versão mais leve do Ubuntu.
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Criação das pastas necessárias para o sistema
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Tecle control + alt +T para abrir o terminal
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No terminal, digite : mkdir scr softwares
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Instalação de softwares de suporte
A instalação dos softwares de suporte será feito completamente pelo terminal por uma sequência de comandos:
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sudo apt-get install vim
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sudo apt-get install build-essential
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sudo apt-get install csh
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sudo apt-get install libgtk-3-dev
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sudo apt-get install libgl1-mesa-dev
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sudo apt-get install gfortran
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sudo apt-get install wx3.0-i18n
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sudo apt-get install wx3.0-examples
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sudo apt-get install wx3.0-headers
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sudo apt-get install wx3.0-doc
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sudo apt-get install synaptic
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Instalação do Quantum espresso /Pwgui/ Xcrysden
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sudo apt-get install quantum-espresso
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sudo apt-get install xcrysden
Faça o download do Pwgui (versão standalone)
No terminal digite
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cd Downloads
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mv nomedoarquivo.tar.gz ../softwares
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cd ../softwares
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tar –xvf nomedoarquivo.tar.gz
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sudo su
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cp pwgui /usr/local/bin/
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Instalação do Gamess / Avogadro
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sudo apt-get install avogadro
Faça o Download do Gamess
No terminal e digite:
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cd Downloads
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ll
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mv nomedoarquivo.tar.gz ../softwares
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cd ../softwares
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tar –xvf nomedoarquivo.tar.gz
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cd gamess
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./config
responda ao questionário, em ordem as resopostas devem ser:
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linux64 | enter | enter | enter | gfortran | 4.8 | none | none | sockets | no | no
continue a instalação
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cd ddi/
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./compddi
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mv ddikick.x ../
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cd ../
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make
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vi rungms
Localize as variáveis “set”, logo abaixo dos comentários (marcados em azul) e modifique as variáveis de maneira que fiquem como estão abaixo demonstradas.
IMPORTANTE: Nesta tela você não poderá usar o mouse, apenas o teclado.Para alterar as informações, aperte a letra para inserir. Não se esqueça de substituir o nome pelo nome do seu computador
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set TARGET=sockets
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set SCR=/home/curie/scr
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set USERSCR=/home/curie/scr
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set GMSPATH=/home/curie/softwares/gamess
IMPORTANTE: para fechar a tela tecle ':wq' e em seguida enter
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sudo su
cp rungms /usr/local/bin/